Фамилия Аймуратова звучит непривычно для русского уха, но её происхождение прозрачно и уводит нас в тюркский мир. В основе лежит мужское имя Аймурат, которое состоит из двух корней: «ай» (луна) и «мурат» (цель, желание, намерение). В буквальном смысле имя означает «лунная цель» или «светлое стремление». Это составное имя — распространённая модель у многих тюркских народов, где к благопожелательному «мурат» добавляют поэтический или сакральный эпитет. Луна в этой традиции — символ чистоты, красоты и постоянства.

Фамилия образована по русской патронимической модели: к имени Аймурат добавили суффикс -ов, который указывает на принадлежность («чей?» — сын Аймурата), а затем — типичное для женских фамилий окончание -а. Таким образом, Аймуратова — это дочь или жена человека по имени Аймурат. Мужской вариант — Аймуратов.

Географически фамилия чаще всего встречается среди народов Северного Кавказа и Поволжья — у башкир, татар, ногайцев, кумыков. В этих регионах имя Аймурат (и его варианты Аймурза, Аймухаммет) было известно с XVII–XVIII веков. Скорее всего, предки носителей фамилии были людьми незнатного происхождения — крестьянами, скотоводами или ремесленниками, которые получили фамилию при переписях или паспортизации в XIX — начале XX века, когда фамилии часто просто записывали по отцу.

В русском языке фамилия сохранила ударение, характерное для исходного имени: Аймура́тов. Написание с буквой «й» в начале — не ошибка, а точная передача тюркского звучания, где «ай» произносится как один слог. Встречаются искажённые варианты (Амуратов, Аймурад), но исходная форма устойчиво держится в документах.