Фамилия Бабалюк — характерный пример украинской модели фамилии, образованной с помощью уменьшительно-ласкательного суффикса -юк. В ономастике этот суффикс указывает на «малого» или «сына»: Бабалюк — это буквально «маленький Бабал» или «сын Бабала». Сама основа «Бабал» — это, скорее всего, вариант прозвища Баба, которое в украинской и польской традициях было широко распространено. Прозвище могло относиться к человеку, который по какой-то причине ассоциировался с женщиной (например, занимался женской работой, был излишне заботлив), или же к тому, кто жил у бабушки, воспитывался ею.

Менее вероятна, но не исключена связь с польским словом «baba» в значении «баба» (женщина) или с глаголом «babić» — «принимать роды». В таком случае прозвище мог получить повитуха или человек, помогавший при родах. Однако для фамилии с суффиксом -юк более типична именно патронимическая модель от личного имени или прозвища отца.

Географически фамилия Бабалюк тяготеет к западным регионам Украины — Волыни, Подолью, Галичине. Встречается она и среди украинской диаспоры в Польше, Канаде и США. В России фамилия редкая, фиксируется в основном в южных областях, куда в разное время переселялись украинские крестьяне.

Сословно носители фамилии в XIX веке были преимущественно крестьянами или казаками. В ревизских сказках и метрических книгах фамилия встречается с конца XVIII века, но её более древние корни уходят в эпоху формирования украинских фамилий на -ук/-юк, которая пришлась на XVI–XVII века.