Фамилия Бабиковы (в мужском варианте Бабиков) построена по самой распространённой в русском языке модели: к основе прозвища или имени Бабик добавили притяжательный суффикс -ов, который буквально означал «чей?» — то есть «сын Бабика» или «потомок Бабика». Разберёмся, что могло стоять за этим прозвищем.

В народной среде Бабиком чаще всего называли бабушкиного любимца, воспитанника, которого «бабка вырастила». Отсюда же пошло и ласкательное обращение к самой бабушке — Бабик. Но прозвище могло иметь и иной, не домашний смысл. На Украине, например, Бабиком дразнили женоподобного, изнеженного или нерешительного мужчину, а также того, кто слишком уж любил ухаживать за женщинами. Есть и версия, что Бабик — это прозвище строителя: в некоторых говорах так называли работника, который месил глину или выполнял «бабью», то есть подсобную, работу.

Иногда фамилию связывают с географическим названием — посёлком Бабик в Хакасии, но для большинства носителей фамилии эта версия менее вероятна: фамилия фиксируется задолго до того, как этот топоним стал широко известен.

Одно из самых ранних документальных упоминаний находим в «Ономастиконе» Степана Веселовского: в 1590 году в Арзамасе жил помещик Савелий Бабиков. Это доказывает, что к концу XVI века фамилия уже прочно бытовала в служилой среде центральной России. Что касается множественного числа «Бабиковы», то оно обозначает род или династию — так говорили «Бабиковы приехали», имея в виду всю семью или несколько поколений.