Фамилия Бабынин образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Фамилия Бабынин образована от прозвища Бабыня. Не исключено, что Бабыней могли прозвать сплетницу. Слово «баба» («бабыня») в русских и малороссийских говорах могло иметь и другие значения. В исторических документах упоминаются однокоренные фамилии: Бабкины, бояре, XV в., Новгород; Афанасий Бабкин, дьяк, 1546—1560 гг., Москва; другой род Бабкиных записан в Твери, отрасль рода Марка Демидова. О точном месте и времени возникновения фамилии Бабынин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Бабынин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.