Фамилия Бадамханов — редкий пример, где русская патронимическая модель (-ов) наложилась на имя тюркского или иранского происхождения. Основа «Бадамхан» состоит из двух частей: «бадам» (в тюркских языках — «миндаль», реже «тело», «стан») и «хан» (титул правителя, князя). Скорее всего, исходное имя Бадамхан — составное, где «хан» выступает традиционным почетным компонентом мужских имен у народов Средней Азии и Кавказа, а первая часть либо указывает на внешность (стройный, как миндаль), либо восходит к персидскому «бадам» — миндаль, что могло быть ласкательным прозвищем. Суффикс -ов указывает, что фамилию русифицировали при документальном оформлении, вероятно, во второй половине XIX — начале XX века, когда представители народов Российской империи получали русские фамилии по отцу.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где исторически смешивались тюркские и персидские влияния: Узбекистан, Таджикистан, северный Афганистан, а также к тюркоязычным народам Кавказа (кумыки, азербайджанцы). В России носители Бадамхановых встречаются среди потомков выходцев из этих областей, часто в Дагестане или у татар. Интересно, что имя Бадам (без «хан») встречается и у калмыков — там оно имеет монгольские корни (бадам — «лотос»), но с добавлением «хан» эта версия менее вероятна, так как в монгольской традиции «хан» — не столько приставка к личному имени, сколько отдельный титул.

Социальный контекст: компонент «хан» в фамилии не обязательно говорит о знатном происхождении предка. В Средней Азии и на Кавказе «хан» часто добавляли к имени как уважительную форму, почти как «господин», и такой элемент мог закрепиться за человеком любого сословия. Поэтому фамилия Бадамханов могла принадлежать и потомку местного правителя, и обычному ремесленнику, чьего отца в округе звали Бадамханом за стройность или за любовь к миндалю. Точных сведений о ранних носителях фамилии в открытых источниках нет — это указывает на её редкость и локальный характер бытования.