Фамилия Бадарханов восходит к мусульманскому имени Бадархан. Как и многие другие арабские имена, оно является составным: основой для него послужили Бадр («совершенный», «полная луна») и Хан («правитель»). Таким образом, Бадархан – «совершенный правитель».