Фамилия Бадырханов — одна из тех, что построена по простой и ясной модели: к основе, восточному мужскому имени Бадырхан, добавили русский патронимический суффикс -ов. Это стандартный способ оформления фамилий у многих тюркских и мусульманских народов, оказавшихся в составе Российской империи: имя отца становилось фамилией сына. Так что Бадырханов буквально означает «сын Бадырхана» или «потомок Бадырхана».

Само имя Бадырхан — составное, и его части ведут из разных языковых традиций. Первый корень, «бадр», — арабского происхождения и переводится как «полнолуние». В мусульманской культуре полнолуние — устойчивый поэтический образ для красоты, ясности, совершенства. Второй корень — «хан» — слово тюркское (хотя через тюркские языки оно распространилось и в Иране, и в Афганистане). Изначально «хан» обозначал вождя племени или правителя. В составных именах «хан» часто служил почётным компонентом, придавая имени вес и достоинство.

Соединение арабского «полнолуния» с тюркским титулом даёт имя, которое можно истолковать как «сияющий правитель» или «хан, подобный полной луне». Это не бытовое прозвище, а намеренно возвышенное, книжное имя, которое могли дать мальчику в семье, где ценили исламскую образованность и уважали традиции степной знати.

Фамилия Бадырханов не слишком распространена. Чаще всего её носители встречаются среди татар, башкир, а также у народов Кавказа и Средней Азии — везде, где имя Бадырхан входило в обиход. В русских документах фамилия могла записываться по-разному: встречается вариант Бадырханов, реже — с ударением на второй слог, Бадырханов, хотя логика словообразования предполагает ударение на последний слог основы: Бадырха́нов.

Стоит отметить, что в русском языке арабское «бадр» иногда путали с тюркским «батыр» (богатырь, храбрец). Поэтому у фамилии Бадырханов есть фонетически близкая, но этимологически иная родня — фамилии Батырханов, Батыршин. Если предки были записаны как Батырхановы, корень там уже не «полнолуние», а «герой». Но в случае Бадырханова основа всё же восходит именно к арабскому «бадр».