Фамилия Бадырханов образована от восточного мужского личного имени Бадырхан, которое является составным и восходит к двум словам: «бадр» и «хан». «Бадр» в переводе с арабского языка означает «полнолуние». Первоначально «хан» обозначал вождя племени (например, у кочевников Ирана и Афганистана).