Фамилия Багапов имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Багапов уходит в XV-XVII вв. Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Багапов являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Фамилия Багапов образована от мусульманского мужского имени Багап, которое представляет собой вариант имени Вагап. В переводе с арабского это имя означает "дающий все, одаривающий всем". Имя Багап преимущественно встречается у мусульман Кавказа. Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Багапов способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Тем не менее, фамилия Багапов представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.