Фамилия Багаратян — редкий случай, когда географическая привязка и языковая основа спорны, но почти наверняка ведут на Кавказ. Судя по суффиксу, это армянская фамилия. В армянском языке суффикс -ян (в старой орфографии -янц) означает принадлежность к роду, происхождение от предка: «из рода такого-то». Ударение в таких фамилиях обычно падает на последний слог: БагаратЯн.

Основа — Багарат. Это армянское имя, восходящее к древнеперсидскому *Bagadata — «богом данный» или «дар бога». В армянской истории имя Баграт (Багратуни) носили представители знатного рода, который дал Армении несколько царей. Однако не стоит думать, что каждый Багаратян — потомок царской династии. Фамилия могла образоваться от простого крестьянского имени Багарат, которое было популярно в народе, или от прозвища, данного по месту жительства (например, село Багаран).

Вторая версия, менее вероятная, но возможная — аварское или лезгинское происхождение. У народов Дагестана есть имя Багара (или Багатар), означающее «герой», «богатырь». Если фамилия возникла в дагестанской среде, суффикс -ян мог появиться позже, под влиянием армянского письма или при русификации. Но это гипотеза без надёжных подтверждений.

Написание фамилии устойчивое: Багаратян, а не Багратян (хотя вариант Багратян тоже встречается). Разница в одну букву — «а» после «г» — указывает на полное звучание имени в основе: Багарат, а не сокращённое Баграт. Это характерно для фамилий, которые записывали со слов носителя, не подгоняя под литературную норму.

В XIX — начале XX века носители фамилии Багаратян фиксировались в Тифлисской и Елизаветпольской губерниях, а также в Карабахе. Сословно это были в основном крестьяне и ремесленники, хотя отдельные ветви могли принадлежать к духовенству или купечеству. Точных данных о дворянстве нет.

Если вы ищете свои корни, стоит проверить метрические книги Армянской апостольской церкви за 1850–1910 годы — именно там фамилия встречается с минимальными искажениями. В советских паспортах её могли записать через «о» (Богаратян) или с двойной «р» (Багарратян), но основной вариант остался прежним.