Фамилия Багаткин образована от прозвища или имени Багатка. Словообразовательная модель здесь простая: к основе на -а добавили типичный русский суффикс притяжательных прилагательных -ин, который в фамилиях указывает на принадлежность: «чей?» — Багаткин, то есть сын или потомок Багатки.

Корень багат- в русских говорах имеет два основных значения. Первое — «богатство, достаток». В диалектах слово «багат» или «багатый» означало «богатый, зажиточный человек». В таком случае прозвище Багатка мог получить либо состоятельный крестьянин, либо, по ироничной народной традиции, бедняк — «наоборот». Второе значение — личное имя Багат (или Багата) из краткой формы крестильного имени Богат, которое в старину иногда давали как охранительное или пожелательное. Прямой связи с тюркскими языками, где «бага» означает «сильный, могучий», нет: суффикс -ткин для тюркских фамилий нетипичен, он указывает на русское происхождение.

Географически фамилия Багаткин редкая. Основные очаги её бытования — центральные области России, особенно бывшая Тульская и Рязанская губернии, где диалектное слово «багат» фиксировалось в XIX веке. Встречается она и в Поволжье, но единично. Сословно носители фамилии, скорее всего, были крестьянами или мещанами: в дворянских родословных книгах Багаткины не значатся.

Известных носителей с этой фамилией в истории нет, что типично для редкой крестьянской фамилии. Исключение составляют лишь случайные упоминания в метрических книгах XIX века. Главная ценность фамилии — в её прозрачной внутренней форме, которая прямо указывает на прозвище, связанное с имущественным положением предка.