Фамилия Богаткин образована от мирского имени или прозвища Богатка. В основе этого прозвища могут лежать сразу несколько значений, и какое из них стало решающим для конкретного человека — сегодня уже не установить, но все версии по-своему интересны.

По одной из них, Богаткой в тверских и смоленских говорах называли растение, известное также как коморник или блошник. С ним был связан народный обычай: на Ивана Купалу втыкали почку этого растения в щель избы или клали под иконы и гадали. Если растение расцветало — к добру, усыхало — к худу. Давая ребёнку такое имя, родители словно поручали его покровительству природы, надеясь, что к малышу перейдут полезные свойства этого представителя растительного мира.

Другая версия отсылает к белорусскому языку, где «богатка» означает радугу. Радуга — символ урожая, плодородия и изобилия, поэтому имя могло нести пожелание богатства и удачи. Наконец, не стоит исключать и самого прямого толкования: Богаткой могли прозвать зажиточного, обеспеченного человека или удачливого земледельца, собиравшего со своих наделов богатый урожай.

Одно из первых упоминаний родственного прозвища встречается в «Ономастиконе» С. Б. Веселовского: записан Богатый Иван, холоп, 1545 год, Новгород. Фамилия Богаткин образовалась по типичной русской модели: к основе Богатк- добавился суффикс принадлежности -ин, указывающий на то, что человек — потомок того, кого звали Богатка.