Фамилия Багимова — женская форма фамилии Багимов. В её основе лежит мужское личное имя или прозвище Багим, которое, скорее всего, имеет тюркское происхождение. В тюркских языках (татарском, башкирском, казахском) существует слово «багым» или «бахим», означающее «судьба», «доля», «удел». Соответственно, имя Багим можно перевести как «судьбоносный», «тот, кому суждено» или «счастливая доля». Это имя могли дать ребёнку, желая ему удачной и благополучной жизни.

Морфологически фамилия образована по классической русской модели: к основе Багим- добавился патронимический суффикс -ов, который указывал на принадлежность («чей?» — сын Багима). Фамилии с таким окончанием — самые распространённые в России, но в данном случае исходное имя нетипично для славянского именослова, что прямо указывает на тюркские корни рода.

Географически фамилия Багимова встречается преимущественно в регионах с татарским и башкирским населением: в Татарстане, Башкортостане, а также в Оренбургской, Челябинской и Самарской областях. Иногда её можно встретить у казахов и крымских татар, где имя Багим (или Бахим) также бытует, но с теми же смысловыми оттенками.

В русской традиции фамилия закрепилась в результате межэтнических контактов, когда тюркские имена адаптировались к русской системе отчеств и фамилий. Предки современных Багимовых, скорее всего, были крестьянами или служилыми людьми из татарских или башкирских родов, принявшими православие или сохранившими ислам, но получившими фамилию по отцу в официальных документах.

Другие возможные версии происхождения менее убедительны. Например, связь с арабским словом «бахим» (что значит «тёмный», «неясный») или с грузинским именем Багим — маловероятны, так как фамилия не имеет массового распространения на Кавказе. Основная версия — тюркская, и она подтверждается как лингвистически, так и географией бытования.