Фамилия Баисова женского рода (мужской вариант — Баисов). В её основе лежит личное имя Баис, которое, по одной из версий, восходит к мифическому животному мечехвосту, называемому также Байасом. Согласно преданиям, это существо обладало невероятной силой — могло хвостом валить деревья в лесу. Давая ребёнку имя Баис, родители вкладывали в него пожелание вырасти сильным и смелым, как этот сказочный зверь.

Впрочем, более убедительной выглядит версия, связывающая имя-основу с тюркскими корнями. В древнетюркском и татарском языках было распространено имя Баиш, которое означало «состоятельный, могущественный друг, товарищ, спутник». Со временем звучание могло измениться до формы Баис, а фамильный суффикс -ов/-ова добавил значение принадлежности: «из дома Баиса», «потомок Баиса». Такая модель образования — от тюркского имени через суффикс -ов — типична для фамилий, возникших в среде поволжских татар, башкир и других народов, испытавших влияние тюркской ономастики.

Окончательно определить, какая из версий верна для конкретной ветви рода, можно только в ходе генеалогического исследования — с привлечением архивных записей, метрических книг и ревизских сказок.