Фамилия Байисова — женская форма, мужской вариант — Байисов. В её основе лежит тюркское имя или прозвище, и география подсказывает, что корни фамилии скорее всего ведут в регионы Северного Кавказа, Поволжья или Средней Азии, где распространены тюркские языки.

Разбираем словообразовательную модель. Первая часть «Бай» — в тюркских языках означает «богатый», «знатный», «господин». Это частый компонент в именах и прозвищах, указывающий на высокое положение или достаток предка. Вторая часть «ис» может быть вариантом имени Иса (библейский Иисус в мусульманской традиции) или корнем, означающим «след», «знак». Возможна и связь с глаголом «исов» — «толочь», «месить», что могло относиться к ремеслу, но это менее вероятно.

Суффикс «-ов» (в женском роде «-ова») — классический русский патронимический суффикс, который присоединяли к тюркским основам при русификации фамилий. То есть изначально предка звали Байис, а его потомков записали как Байисовы. Такая модель типична для многих фамилий, возникших в среде татар, башкир, кумыков, ногайцев и других тюркских народов, вошедших в состав Российской империи.

Самая правдоподобная версия: фамилия образована от личного имени Байис (Бай-Иса — «богатый Иса», «знатный Иса»). В этом случае предок был мусульманином, носившим имя в честь пророка Исы, и получил прозвание за своё богатство или происхождение. Встречается и вариант, где «ис» — это диалектное окончание, и имя звучало как Байыс, что могло означать «богатый след» или «знатный знак» — метафорическое прозвище удачливого человека.

Фамилия редкая, в современных базах встречается единично, в основном в регионах с тюркским населением. Сословно предки могли быть как крестьянами, так и мелкими князьями или мурзами — компонент «бай» в имени не обязательно гарантировал реальное богатство, но подчёркивал статус.