Фамилия Бакалинова — отчество второго порядка: её основатель был сыном Бакалина и внуком Бакалы. Такой способ образования (суффикс -ов, присоединённый к отчеству на -ин) типичен для русских фамилий, но встречается реже, чем простая модель «прозвище + -ов». В центре фамилии — прозвище Бакала, и его происхождение неоднозначно.

Первая версия ведёт Бакалу к арабскому «баккал» — бакалейщик, мелкий торговец, лавочник. В тюркских языках, через которые слово могло попасть в русские говоры, оно сохранило то же значение. Тогда прозвище указывало на занятие предка: торговля мелочным товаром.

Вторая гипотеза выводит прозвище из киргизского «бакал» — солома. Если это так, Бакалой могли называть крестьянина, занятого заготовкой соломы, или мастера, плетущего из неё шляпы и другие изделия. Эта версия менее распространена, но лингвистически возможна, особенно в регионах с тюркским влиянием.

Наконец, есть связь с диалектным словом «бакалдина» — так в некоторых областях, по В. Далю, называли глухой заливец или ямину, которая весной наливается водой и остаётся озерком. Отсюда могло возникнуть прозвище Бакалина, а уже от него — фамилия Бакалинов. В этом случае корень указывает не на занятие, а на место жительства: рядом с такой низиной или старицей.

Какая из версий правдоподобнее? Торговая (от «баккал») подкреплена широким бытованием арабских заимствований через тюркское посредничество. Географическая (от «бакалдина») — реальным диалектным словом, но она объясняет только форму Бакалина, а не более вероятную основу Бакала. Соломенная версия остаётся самой слабой из-за узкого ареала исходного слова.

Фамилия Бакалинова — нечастая. Её носители могут встретиться в Поволжье и южных регионах, где исторически сильны тюркские и арабские влияния. Точных данных о сословной принадлежности рода нет, но отчество второго порядка чаще встречалось у крестьян и мещан, а не у дворян.