Фамилия Бакченко звучит на украинский лад, и это первая зацепка для её разбора. Суффикс -енко — один из самых распространённых в украинской ономастике, он указывает на происхождение по отцу: Бакченко буквально означает «сын Бакчи» или «потомок Бакчи». Такая модель в XVI–XVIII веках была типична для казацкой старшины, мещан и крестьян Левобережной и Слободской Украины.

Основа фамилии — Бакча — это неканоническое личное имя или прозвище. Споры о его корнях сводятся к двум версиям. Первая: от тюркского «бакча» (садовник, огородник) или «бакше» (писарь, учитель). Учитывая многовековое соседство украинских земель с Крымским ханством и Османской империей, такое заимствование вполне вероятно. Вторая версия, более прозаичная: от диалектного украинского слова «бакча» — так в некоторых регионах называли бахчу, то есть место, где растут арбузы и дыни. Тогда прозвище Бакча мог получить человек, который торговал бахчевыми или возделывал их.

Встречаемость фамилии неравномерна. По данным переписей и телефонных справочников, Бакченко чаще всего фиксируется в центральных и восточных областях Украины — Полтавской, Черкасской, Кировоградской, а также в приграничных регионах России (Белгородская, Курская области). Это подтверждает, что фамилия сформировалась на юго-востоке украинского языкового ареала, где тюркские заимствования в бытовой лексике не редкость.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Бакченко стоит в одном ряду с Бакченков (русифицированный вариант с суффиксом -ов), Бакчин (с окончанием -ин) и Бакчук (с суффиксом -ук, типичным для Западной Украины). Различие в суффиксах как раз показывает, в какой историко-административной области закрепилась фамилия. Бакченко — это маркер территории, где в XVII–XVIII веках активно действовала модель отчества на -енко, вытеснившая более древние формы.

Сословная принадлежность первых носителей, скорее всего, была крестьянской или казацкой. В реестрах Войска Запорожского встречаются прозвища, образованные от тюркских корней, и Бакченко могло быть фамилией казака, несшего сторожевую службу на южных рубежах. Дворянских родов с такой фамилией в Российской империи не зафиксировано — нет её в «Бархатной книге» или «Общем гербовнике». Значит, фамилия осталась в народной среде, что для украинских фамилий на -енко, в общем, типично.