Фамилия Бакирханов ведет свое начало от мужского имени Бакирхан, состоящего из двух компонентов. Первая часть имени – Бакир – имеет арабское происхождение и переводится на русский язык как «обучающийся, изучающий; достигающий», «рано созревший, быстро выросший». Вторая часть имени – Хан – в переводе с персидского означает «правитель, повелитель». Таким образом, имя Бакирхан можно перевести как «мудрый правитель». Вероятно, нарекая ребенка таким именем, родители желали своему сыну достичь мудрости и власти. Тюркский корень -огло/-оглу/-оглы (в переводе «потомок, сын») типичен для турецких, гагаузских и прочих тюркских фамилий.