Фамилия Баклан восходит к прозвищу Баклан, которое является производным от нарицательного «баклан» - «большая водоплавающая птица». Как правило, Бакланом называли большеголового человека. Существовала поговорка: «Велик баклан, да есть изъян». Однако такое прозвище могли дать и неповоротливому, крупному, а также не очень сообразительному. Нельзя исключить связь прозвища с диалектными глаголами «бакланить, баклушить, баклушничать», т.е. Однако существует и другая, менее правдоподобная версия, согласно которой, слово «баклан» имеет тюркское происхождение и означает «гусь».