Фамилия Бакусев — это русский вариант немецкой фамилии Бакус (Bacus), которая, в свою очередь, произошла от слова Backhaus, то есть «пекарня». Изначально в России фамилия могла звучать как Бакусов, но со временем окончание -ов перешло в -ев, что не редкость для фамилий, образованных от основ на мягкий или шипящий согласный. Суффикс -ев указывает на принадлежность: Бакусев буквально значит «сын Бакуса» или «из семьи Бакуса».

Носители немецкого прозвища Бакус появились в России несколькими волнами. Первая — ещё в XVI веке, во время Ливонской войны 1558–1583 годов, когда пленных немцев тысячами расселяли по русским городам. Они привозили с собой ремёсла и считались лучшими мастерами. Вторая, более массовая волна пришлась на 1762–1763 годы, когда Екатерина II манифестами пригласила европейцев селиться на Волге. Тысячи выходцев из немецких государств основали колонии на территории современных Саратовской и Волгоградской областей. Именно в этой среде фамилия Бакус и её производные получили распространение.

Таким образом, предок Бакусевых почти наверняка был пекарем или владельцем пекарни. Прозвище, данное по профессии, закрепилось как фамилия и было русифицировано при помощи типичного русского патронимического суффикса. В отличие от многих других «профессиональных» фамилий, здесь сохранилась прямая связь с конкретным немецким корнем, что делает происхождение Бакусевых более прозрачным, чем у большинства фамилий, образованных от прозвищ.