Фамилия Балабошин является фонетическим вариантом фамилии Балабашин. Она образована от имени Балабаш, которое состоит из двух частей: «бала» и «баш». Первая из них с тюркского языка переводится как «ребёнок, дитя, младенец, малыш», «сын или дочь (независимо от возраста)», а вторая – «голова».