Фамилия Балабушенко — украинская по происхождению, что выдает суффикс -енко. В Украине и на юге России такие фамилии были типичны для казацкой среды и крестьянства: -енко означало «сын» или «потомок». Балабушенко — это буквально «сын Балабуша» или «маленький Балабуш».

Основа фамилии — прозвище Балабуш. Корень «балаб-» в славянских языках связан с болтовней, пустой речью (сравните «балабол», «балабонить»). Человек с таким прозвищем мог быть говорливым, не в меру болтливым или тем, кто любил рассказывать байки. В украинских говорах есть и слово «балабушка» — так называли лепёшку, сдобную булку. В этом случае прозвище могло достаться пекарю или любителю выпечки. Обе версии правдоподобны, но первая — с болтовнёй — встречается чаще: прозвища по речевым особенностям давали очень охотно.

Интересная деталь: фамилия Балабушенко географически привязана к восточной и центральной Украине. Она редка за пределами бывшей Гетманщины (Черниговщина, Полтавщина, Киевщина), где модель на -енко была особенно распространена. В российских переписях XIX века она почти не встречается, что подтверждает её локальный украинский характер.

В отличие от более частых Балабух или Балабанов, Балабушенко сохранила уменьшительно-ласкательный оттенок: «балабуш» звучит мягче, чем «балабол». Возможно, прозвище дали не за злую болтовню, а за добродушную говорливость. Никаких дворянских корней у этой фамилии нет — типичная казацкая или крестьянская, без претензий на громкую историю.