Фамилия Балаховцевы — редкий пример того, как фамилия, имеющая географическую основу, сохранила «внутреннюю» форму отчества. В своей основе она отсылает к названию населённого пункта — скорее всего, города Балахна (в Нижегородской области, а не Саратовской, как иногда ошибочно указывают) или деревни Балахи в Псковской области. Человек, переселившийся оттуда, получал прозвище Балаховец — «житель Балахны» или «выходец из Балахи». От этого прозвища и пошла фамилия.

Однако здесь есть лингвистическая деталь, которая не бросается в глаза. Форма Балаховцев — это не просто «сын Балаховца», а скорее отчество второго порядка: Балаховцев означает «внук Балаха» (через промежуточное отчество Балахов). То есть фамилия закрепилась не за самим переселенцем, а за его потомком, что указывает на довольно ранний период формирования — когда фамилии ещё только начинали передаваться по наследству, и патроним мог «наращивать» суффикс.

Корень Балах- имеет тюркские параллели. Наиболее убедительная версия связывает его с тюркским bala — «ребёнок, дитя»: так могли назвать младшего сына или просто ласково обратиться к мальчику. Менее вероятно, но не исключено, что в основе лежит bal — «мёд» (прозвище сладкого, доброго человека) или bolluq — «богатство, изобилие». В любом случае, имя Балах было личным именем в древнерусской среде, и от него через цепочку «Балах — Балахов — Балаховцев» сформировалась современная фамилия.

География фамилии сегодня редкая, рассеянная: единичные носители встречаются на юге России и в центральных областях, что подтверждает версию о выходцах из одного конкретного места, а не о массовом роде.