Фамилия Баламутов образована от прозвища Баламут, которое восходит к аналогичному нарицательному. Баламутом называют «того, кто вызывает беспокойство, вносит беспорядок, раздор», а также «подстрекателя, смутьяна». Вполне вероятно, что такое прозвище получил неугомонный, деятельный человек. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Баламут, со временем получил фамилию Баламутов.