Фамилия Баламута — редкий случай, когда прозвище перешло в фамилию почти без изменений, без типичных фамильных суффиксов -ов, -ин или -ский. Это так называемая «прозвищная» фамилия, застывшая в форме именительного падежа. В русской ономастике такой тип встречается нечасто и обычно указывает на позднее оформление фамилии или на её украинское, белорусское происхождение, где подобные бессуффиксные модели распространены шире.

Основа фамилии — слово «баламут». В древнерусском языке и народных говорах так называли человека, который вносит смуту, раздор, беспорядок. Глагол «баламутить» означал «мутить воду», «возбуждать», «ссорить людей». Прозвище Баламут могли дать не только скандалисту или сплетнику, но и, в более мягком смысле, — шалуну, озорнику, который постоянно затевает игры и переполох. В некоторых диалектах слово имело ироничный оттенок: так могли назвать болтуна или пустомелю.

Если рассматривать словообразовательную цепочку, то корень здесь — «бала-» (звукоподражательный или связанный с «болтать», «балаболить») и «-мут» от «мутить». Получается сложное слово, описывающее человека, который «болтовнёй мутит». Аналогичные по модели фамилии — Балаболь, Пустомеля, Непоседа — все они относятся к группе так называемых «говорящих» прозвищ, которые напрямую характеризовали поведение носителя.

Встречается фамилия Баламута преимущественно в южных и западных регионах бывшей Российской империи — на Украине, в Белоруссии, а также в южнорусских областях (Курская, Воронежская губернии). В официальных документах XIX — начала XX века носители этой фамилии чаще всего были крестьянами или мещанами. Прозвище не давало социальных привилегий, а скорее фиксировало заметную черту характера, по которой человека знали в округе.

Важно не путать с фамилией Баламутов, которая образована по стандартной модели с суффиксом принадлежности (-ов) и означает «сын Баламута». Форма Баламута — более архаичная и прямая: это не «чей-то», а сам Баламут. В современных переписях такая фамилия встречается редко, что делает её особенно ценной для генеалогического поиска — она не размыта в массе однофамильцев.