Фамилия Балаухин — редкий случай, когда на поверхности лежит прозвище, а под ним скрывается целый пласт забытых ремёсел. Основа фамилии — слово «балаух» или «балауха». В русских говорах так называли не просто болтуна или пустомелю (хотя и это значение известно), а человека с определённой манерой речи — говорливого, но не злого, того, кто любит «балакать», то есть вести неспешную беседу. Однако есть и вторая, более предметная версия.

В некоторых регионах «балаухой» называли большую деревянную колотушку или тяжёлый молот — орудие, которым пользовались плотники, бондари или кожевенники при разминании кож. Прозвище Балауха могли дать человеку крепкого телосложения, работающему с таким инструментом, или, в переносном смысле, неуклюжему, «тяжёлому на руку» работнику. Фамилия образована по типичной восточнославянской модели: к основе на -а добавили притяжательный суффикс -ин, означающий «чей?» — «сын Балаухи».

С географической точки зрения фамилия тяготеет к северным и центральным областям России — Вологодчине, Костромской, Кировской и Пермскому краю. Именно в этих местах диалектное слово «балаух» зафиксировано в словарях местных говоров, и именно оттуда идёт большинство известных носителей фамилии. Встречается она нечасто, что подтверждает её узкорегиональное происхождение.

Словообразовательный нюанс: суффикс -ин, а не -ов, указывает на то, что прозвище оканчивалось на гласный. Если бы предка звали Балаух, фамилия звучала бы как Балаухов. Форма на -ин встречается реже и обычно говорит о более древнем, долитературном закреплении прозвища, когда его ещё не успели «подогнать» под более массовую модель на -ов. Таким образом, Балаухин — не «сын Балауха», а именно «сын Балаухи», что сохраняет память о прозвище, бытовавшем в мужском роде с женским окончанием (как, например, Савва — Саввин).