Фамилия Балкишев образована от имени Балкиш, которое, скорее всего, представляет собой диалектный вариант булгарско-татарского имени Балкыш. На русский язык оно переводится как «сияющая, лучезарная». Также не исключено, что имя Балкиш ведет свое начало от имени Бал, которое в переводе с тюркско-татарского языка означает «мед», «медовуха; брага». Возможно, что родители, нарекая своего ребенка таким именем, желали ему сладкой, беззаботной, хлебосольной жизни. Таким образом, потомок человека, которого звали Балкиш, со временем получил фамилию Балкишев. Тюркский корень -огло/-оглу/-оглы (в переводе «потомок, сын») типичен для турецких, гагаузских и прочих тюркских фамилий.