Фамилия Балыбердина — женская форма фамилии Балыбердин, которая образована от мусульманского мужского имени Балыберди. Это имя восточного, скорее всего тюркского, происхождения, и его разбор сразу даёт ключ к значению фамилии. Первая часть имени, «балы», восходит к древнетюркскому слову «бал» — «мёд». В тюркской ономастике «бал» часто использовалось в именах как символ сладости, приятности или ценности. Вторая часть, «берди», происходит от тюркского слова со значением «дал», «дар» (в контексте «дар божий» или «данный богом»). Таким образом, имя Балыберди можно перевести как «медовый дар» или «сладкий дар».

Такая двухчастная модель характерна для многих тюркских имён, где первая часть описывает качество, а вторая — акт дарения (ср. Аллаберди, Кулберди). Скорее всего, имя Балыберди давали ребёнку с пожеланием, чтобы он был сладким, как мёд, и воспринимался как подарок свыше. Позднее это имя превратилось в фамилию с помощью типичного русского суффикса принадлежности -ин, который указывает на родство: Балыбердин — «сын Балыберди» или «из семьи Балыберди». Форма Балыбердина — женский вариант той же фамилии.

Фамилия Балыбердиных — редкая, и её география, вероятно, связана с регионами, где исторически были сильны тюрко-мусульманские влияния: Поволжье, Приуралье, Западная Сибирь. В русской среде такие фамилии могли появиться через межэтнические контакты или после крещения носителей тюркских имён. Процесс закрепления фамилий был долгим, поэтому точное место и время возникновения конкретной ветви рода Балыбердиных можно установить только по архивным генеалогическим записям.