Фамилия Бандоев — редкая и территориально привязанная. Её основа и суффикс указывают на восточное, скорее всего, бурятское или монгольское происхождение, а окончание «-ев» — на позднюю русскую адаптацию при фиксации в документах.

Корень «Бандо» восходит к личному имени или прозвищу. В бурятском и монгольском языках «банди» (или «бандэ») означает «послушник», «ученик», «младший монах» — так называли мальчиков, отданных в буддийские дацаны для обучения. Имя Банди (Бандо) было распространено в Бурятии и Калмыкии как мирское, данное в честь посвящения в послушники или просто как благопожелательное. Суффикс «-ев» в фамилии Бандоев — типичный для русской паспортной системы, которая переоформляла тюркские и монгольские имена по модели отчества: «сын Бандо» → Бандоев.

Вторая, менее вероятная версия — связь с осетинским мужским именем Бандо, которое является краткой формой от Баграт или Банди. Однако для осетинских фамилий более характерен суффикс «-ты» (Бандо-ты), а не «-ев». Поэтому бурятская версия выглядит убедительнее.

Географически фамилия Бандоев встречается преимущественно в Восточной Сибири, в первую очередь в Бурятии и Иркутской области, а также среди бурятской диаспоры в Монголии. Это локальная фамилия, не вышедшая за пределы региона массового расселения бурят. Носители такой фамилии — потомки людей, чьи предки были связаны с буддийской общиной или получили имя по обычаю отдавать детей в учение.

С точки зрения словообразования фамилия прозрачна: основа «Бандо» + патронимический суффикс «-ев». Ударение, скорее всего, падает на второй слог: БандОев.