Фамилия Бадоев — фамилия-отчество, образованная от личного имени Бадо. В осетинской среде имя Бадо восходит к родовому именованию «бад» — так называли одно из древних осетинских родовых подразделений. Потомок человека по имени Бадо со временем получал фамилию Бадоев, где суффикс -ев указывает на принадлежность к роду.

Есть и другая версия: имя Бадо могло прийти из персидского языка, где корень «бад» означает «миндаль». В таком случае прозвище могло относиться к внешности или характеру человека — например, к форме глаз или мягкости нрава. Какая из гипотез точнее, сказать сложно, но осетинский корень выглядит более обоснованным: он подтверждается географией фамилии.

Основной регион бытования фамилии — Северная Осетия. В Книге памяти Республики Северная Осетия — Алания записаны несколько носителей конца XIX — начала XX века: Джерри Камболатович Бадоев (1895 г.р.), Казбек Исаевич Бадоев (1901 г.р.) и Темир Сосланбекович Бадоев (1888 г.р.) — все из селения Тулатово. Это говорит о том, что фамилия была распространена в конкретном осетинском ауле, а её носители принадлежали к разным ветвям одного рода.

Фамилия редкая и за пределами Осетии почти не встречается. В написании возможен вариант Бадаев, но это уже другая фамилия, связанная с тюркским именем Бадай. Для Бадоева характерен именно суффикс -ев, типичный для русских фамилий, образованных от основ на -о.