Фамилия Багдоев — пример образования от личного имени или прозвища через осетинский суффикс принадлежности. Основа здесь — «Багдо», а суффикс «-ев» (фонетический вариант «-ов» после мягкого согласного) указывает на значение «сын Багдо» или «из рода Багдо». Это типичная патронимическая модель для фамилий народов Кавказа, особенно осетин, где фамилии часто заканчиваются на «-ты» (в русской передаче — «-ев», «-ов»).

Имя Багдо, скорее всего, восходит к осетинскому «багъда» — «счастье, удача» или «благодать». В осетинском языке это слово имеет иранские корни, родственные персидскому «бахт» (судьба, счастье). Таким образом, прозвище Багдо могли дать человеку, которого считали счастливым, удачливым, или же как пожелательное имя — чтобы жизнь сложилась благополучно.

Географически фамилия Багдоев наиболее плотно представлена в Северной Осетии и среди осетинской диаспоры. Встречаются варианты написания — Багдоев и Багдоев, второй вариант точнее передаёт осетинское произношение с ударением на первый слог: Бáгдо. В русских документах закрепилась форма с одной «о» из-за адаптации к правилам русской орфографии.

Интересно, что фамилия эта не очень распространённая — она относится к числу редких даже в самой Осетии. Это может говорить о том, что род Багдоевых не был многочисленным или разветвлённым, либо фамилия возникла сравнительно поздно, уже в XIX веке, когда осетинам массово записывали фамилии в метрические книги. В сословном отношении носители фамилии могли быть как из числа горских крестьян, так и из фамилий уважаемых старшин — само имя Багдо не несёт социальной окраски.

Другие версии происхождения, например, от тюркского «багда» (связка, пучок), маловероятны: осетинская огласовка и ареал бытования фамилии указывают именно на иранскую основу. Если и есть параллели в других кавказских языках, то это, скорее всего, заимствования из осетинского.