Прозвище Бардак восходит к аналогичному древнерусскому нарицательному (возможно, заимствованному у тюркских народов). В старину бардаком называли глиняный горшок с широким отверстием (в тюркских языках «бардак» - это «кувшин»). Возможно, прозвище Бардак относилось к профессиональным именованиям, указывающим на род деятельности предка: он мог быть гончаром. Также своё прозвище человек мог получить за какое-либо внешнее сходство с горшком. Согласно другой версии, прозвище Бардак связано со словом «барда», которое имеет несколько значений: «остатки от перегона хлебного вина из браги», «мутное, дурное питье», «плохая, бесплодная, болотная или каменистая почва». Поэтому можно предположить, что основатель рода Бардаковых занимался изготовлением хлебного вина или получил в собственность земельный участок с бесплодной почвой. Существует ещё одна гипотеза, которая возводит фамилию Бардаков к еврейскому мужскому имени Бардак. Это имя представляет собой сокращение от выражения «бэн рабби Давид Калонимус» - «сын раввина Давида Калонимуса». Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Бардак, со временем получил фамилию Бардакова.