Фамилия Бардухов — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В ней нет типичного для русских фамилий суффикса -ин или -ский, зато есть тюркский или кавказский след. Основа «Бардух» могла прийти в русскую ономастику двумя путями, и оба ведут к прозвищу или имени.

Первый и самый вероятный вариант: фамилия образована от прозвища Бардух, которое восходит к тюркскому слову «бардак» или «бардух» — в разных диалектах это «беспорядок, смута, развал». Прозвище могли дать человеку суетливому, неорганизованному или, наоборот, тому, кто постоянно попадал в переделки. В русских говорах слово «бардак» закрепилось именно в значении «хаос», но в тюркских языках у него есть и более нейтральные смыслы, например «кувшин» или «сосуд». Впрочем, для прозвища значение «беспорядок» правдоподобнее — оно ярче и легче прилипало к человеку.

Второй вариант — фамилия могла возникнуть от мусульманского имени Бардух, которое встречается у народов Северного Кавказа и в Закавказье. Это имя не арабское, а местное, и его этимология до конца не ясна. Если так, то фамилия Бардухов — это русифицированная форма патронима: «сын Бардуха». Суффикс -ов типичен для русских фамилий, которые давали нерусским по отцу: Бардух → Бардухов.

Географически фамилия тяготеет к югу России и Поволжью — регионам, где веками соседствовали русские и тюркские народы. Встречается она в документах XIX века среди казачества и крестьянства, но массовой никогда не была. Это фамилия, которая могла принадлежать человеку, чей предок получил прозвище за характер, или выходцу из горских народов, осевшему в русской среде.

С точки зрения словообразования, модель проста: основа Бардух + патронимический суффикс -ов. Ударение, скорее всего, на втором слоге: Барду́хов. В дореволюционных записях встречается вариант написания через «о» — Бардохов, что подтверждает связь с «бардаком» в произношении.