Фамилия Башкардин — одна из тех, что выдают связь с тюркским миром, а точнее — с башкирским этносом. В её основе лежит прозвище Башкард, которое является фонетическим вариантом слова «башкорт» — самоназвания башкир. Модель образования типична для русских фамилий: к основе на твёрдый согласный добавили суффикс принадлежности -ин, и получилось «сын Башкарда» или «из рода Башкарда». Обратите внимание на суффикс: -ин, а не -ов, что характерно для фамилий, образованных от прозвищ или имён, заканчивающихся на -а/-я, но здесь он присоединился к основе, которая в русском языке осмыслялась как мужское прозвище.

Слово «башкорт» составное. Первая часть — «баш» — по-тюркски значит «главный», «голова». Вторая — «корт» — многозначна. В одном из значений это «волк», и тогда «башкорт» можно перевести как «главный волк» или «волк-вожак». Такое толкование укладывается в традицию тюркской зооморфной символики, где волк — тотемный предок и вожак. Но у слова «корт» есть и другое значение: «круг людей», «племя», «род». В этом случае «башкорт» означает «главное племя» или просто «народ». Какая версия правдоподобнее? Этимологи склоняются к «волку» как к более древнему и мифологически нагруженному смыслу, но в бытовом употреблении прозвище чаще закреплялось по этническому признаку.

Прозвище Башкард, а затем и фамилия Башкардин, скорее всего, закрепились за русским человеком, который долго жил среди башкир, перенял их обычаи или внешне был на них похож. Либо — за башкиром, перешедшим на русскую службу и получившим фамилию по русской модели. Географически фамилия тяготеет к регионам, где исторически были тесные русско-башкирские контакты: Оренбуржье, Урал, Поволжье. Встречается она нечасто, что говорит о её локальном происхождении — в отличие от массовых фамилий на -ов, эта сохранила связь с конкретным прозвищем и не разошлась широко по стране.