Фамилия Башковская — это в первую очередь «географический» отпечаток, типичный для польской, украинской и белорусской традиции именования. Суффикс -ск-/-цк- указывает на дворянское или шляхетское происхождение, но не гарантирует его: в XIX веке такие фамилии массово получали и крестьяне, и мещане при переходе на официальные документы. Основа — топоним Башково или Башков. На карте Восточной Европы таких названий несколько: деревни Башково есть в Витебской области Беларуси, в Смоленской и Псковской областях России, а также в Польше (Baszków). Человек, получивший фамилию Башковский (женская форма — Башковская), скорее всего, был выходцем из одного из этих мест, либо владельцем имения с таким названием.

Корень Башк- вызывает споры. Самая прямая версия — от тюркского слова «баш» (голова, главный). В русских говорах «башка» означала голову, а «башковитой» называли смышлёную, толковую лошадь или человека. Однако для польско-литовского ареала, где фамилия встречается чаще, естественнее связать основу с именем Башко — уменьшительной формой от Бартош, Бенедикт или Себастьян (через народное Баш). В актах XVI–XVII веков встречаются записи о крестьянах и шляхтичах Башко, от которых и пошла фамилия по отцу.

Ударение в фамилии плавающее. В русском языке чаще говорят БашкОвская (по аналогии с московскими фамилиями на -овский), но в украинском и польском вариантах ударение может падать на первый слог — БАшковская, что ближе к исходному названию деревни. Встречается также написание через «а» — Башковска, если фамилия записана по польским правилам.

Сословная принадлежность предков неоднозначна. Если фамилия образована от имения — предки могли быть шляхтой (мелкопоместной, часто однодворческой). Если от деревни Башково в Беларуси или России — скорее крестьяне или мещане, получившие фамилию при переписи. В польских гербовниках (например, у Тадеуша Гайля) фамилия Башковский не упоминается среди гербовой шляхты, что указывает на её позднее и преимущественно разночинное происхождение. Сегодня носители фамилии рассеяны по всей бывшей Речи Посполитой, но чаще встречаются в западных областях Украины, в Беларуси и среди потомков эмигрантов в США и Канаде.