Фамилия Батин — это отчество второго порядка, образованное от прозвища Батя. Слово «батя» в русских говорах имело несколько значений: отец, старший родственник, уважаемый человек. В деревнях так часто называли священника — отсюда версия, что фамилию мог получить сын попа или батюшки. В симбирских говорах слово «батяня» означало не только «батька», но и «брат» или «приятель, товарищ», что расширяет круг возможных прозвищных значений.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Батин — «сын Бати», то есть потомок человека, которого звали или прозвали Батей. Такая модель — одна из самых распространённых в русской антропонимии, наряду с суффиксами -ов/-ев. К этому же ряду относятся фамилии Батеньков, Батянин, Батюшков, Батищев, Батяев — все они восходят к одному корню, но различаются суффиксальными вариантами прозвища.

Существует и маловероятная гипотеза о связи фамилии с болгарским городом Батин на реке Янтре. В августе 1810 года у этого города произошло сражение Русско-турецкой войны — русская армия генерала Каменского (21 тыс. человек) разбила турецкое войско сераскера Кушакчи (30 тыс.). Версия, что предок носителя фамилии был жителем Батина, слаба: топонимические фамилии с суффиксом -ин обычно образуются от русских названий (например, Москвин — из Москвы), а для болгарского топонима естественнее было бы окончание -ский или -ов.

Точное место и время возникновения фамилии Батин установить сложно: процесс формирования русских фамилий растянулся на несколько столетий, с XV по XVII век. Но ясно одно: её основа — живое народное слово, которое в разных говорах обозначало и отца, и священника, и просто старшего товарища.