Фамилия Батонкин образована от прозвища Батонка. Оно ведет свое начало от нарицательного «батон» - «хлеб вытянутой формы». Это слово было заимствовано в XVIII веке из французского языка, где «baton» восходит к латинскому «bastum» - «палка». Вероятно, прозвище относится к числу «профессиональных» именований, содержащих указание на деятельность основателя фамилии: он мог быть хлебопекарем, булочником. Хотя не исключено, что так прозвали высокого человека. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Батонка, со временем получил фамилию Батонкин.