Фамилия Байболотов — яркий пример того, как сложное восточное имя превратилось в русскую фамилию с типичным окончанием. Её основа составная, и разобрать её стоит по частям, отбросив привычный суффикс -ов.

Первая часть, «Бай», — тюркское слово, означающее «богатый», «господин», «хозяин». В именах и прозвищах это был социальный маркер: Бай — человек состоятельный или уважаемый, часто старший в роду. Вторая часть, «Болот», — это арабское имя «Булат» (сталь) в тюркской огласовке. «Болот» — это сталь, крепкий, как булат. Соединившись, «Байболот» даёт значение «богатый, как сталь», «крепкий господин» или «господин-сталь». Имя это было пожелательным: родители желали мальчику несгибаемой силы и богатства.

Фамилию образовали по русской модели: к основе Байболот прибавили патронимический суффикс -ов, который в данном случае отвечает на вопрос «чей?». Байболотов — буквально «сын Байболота», «принадлежащий Байболоту». Важно, что суффикс -ов, а не -ин, хотя имя заканчивается на твёрдый согласный. Это стандартный способ адаптации тюркских имён в русской среде.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где исторически смешивались тюркские и славянские традиции: Северный Кавказ (особенно Карачаево-Черкесия, Кабардино-Балкария), Поволжье (Татарстан, Башкортостан), а также юг Урала и Сибирь. Носители фамилии — потомки тех, кого в документах XIX века записывали по отцу как «Байболотов сын». Сословный состав был разным: от казаков и крестьян до мелких торговцев и служилых людей, принявших православие или сохранивших мусульманскую веру, но получивших русскую форму фамилии.

Встречаются варианты написания с одной «о» — Байболотов, но реже. Иногда путают с фамилией Байбулатов (от имени Байбулат), где вторая часть та же, но огласовка иная. Байболотов — более редкая форма, сохранившая именно «болотный» вариант имени, что указывает на конкретный диалект или региональную традицию произношения.