Фамилия Байдула звучит необычно для русского уха, и это сразу подсказывает, что её корни лежат в тюркских языках. В основе лежит распространённое у многих тюркских народов имя Байдула. Оно составное: «бай» означает «богатый, знатный, хозяин», а «дула» — это арабское слово «Абдулла» (раб Аллаха) в сокращённой форме. Таким образом, имя Байдула можно перевести как «богатый раб Божий» или «знатный слуга Всевышнего». В мусульманской традиции такие имена подчёркивали одновременно и благочестие, и высокий статус человека.

Словообразовательная модель фамилии проста и типична для восточных окраин Российской империи. Фамилия Байдула — это застывшая форма полного имени, без добавления русских суффиксов -ов, -ев или -ин. Такое оформление характерно для фамилий тюркского происхождения, которые фиксировались в документах в исходном виде. Носители фамилии — это, скорее всего, потомки людей, которых в метриках или ревизских сказках записали просто по имени: «Байдула», и это имя перешло к детям как родовое прозвание.

Географически фамилия Байдула тяготеет к регионам с традиционно мусульманским и тюркоязычным населением. Её можно встретить у татар, башкир, казахов, а также у народов Северного Кавказа, где имя Байдула также было в ходу. В русских архивных документах фамилия начинает встречаться с XVIII–XIX веков, когда происходил массовый учёт нерусского населения империи. В отличие от многих крестьянских фамилий, образованных от прозвищ, Байдула почти наверняка восходит именно к личному имени, а не к характеристике внешности или занятия.

Стоит отметить, что в русской среде фамилия могла подвергаться искажению на письме. Встречаются варианты Байдуллин (с добавлением татарского патронимического суффикса -ин) или Байдулов (с русифицированным окончанием). Однако форма Байдула — самая архаичная и прямая, она сохранила исходный облик имени-основы без дополнительных формантов. Это редкий случай, когда фамилия не «обрусела» до конца.