Фамилия Байкенова — женская форма фамилии Байкенов. Её основа восходит к тюркскому миру, и здесь интересно не столько само имя, сколько модель, по которой фамилию образовали. В русском языке фамилии на -ов/-ев обычно означали принадлежность: «чей?» — «сын такого-то». Но Байкенов — это не «сын Байкена» в прямом славянском смысле, а скорее русифицированная запись казахского или башкирского родового имени.

Корень «Байкен» — составное имя. Первая часть «Бай» в тюркских языках означает «богатый, знатный, господин». Вторая часть «кен» может восходить к слову «кен» (широкий, просторный) или, что вероятнее, к личному имени Кен (как сокращение от Кенес, Кенже — «младший» в казахском). Таким образом, Байкен — это «богатый младший» или «знатный простором» — типичное для кочевой культуры имя-пожелание, чтобы ребёнок вырос обеспеченным и с широкой душой.

Суффикс -ов не тюркский, а русский. Его добавили в XIX–XX веках, когда казахов, башкир, татар массово вносили в метрические книги и приписывали стандартные русские фамильные окончания. Поэтому Байкеновы — это потомки человека по имени Байкен, чья семья жила в регионах, где соприкасались тюркская и русская административная культура: Западный Казахстан, Оренбуржье, Башкортостан.

Если искать параллельные фамилии, то Байкенов стоит в одном ряду с Баймуратовым, Байгалиевым, Баймагамбетовым — все они построены по одной схеме: «Бай» + личное имя + русский суффикс. Споров о происхождении почти нет — версия с тюркским составным именем самая прямая и подтверждается географией фамилии: основная масса Байкеновых живёт в Казахстане и прилегающих областях России.

В дореволюционных документах фамилия могла писаться через «а» — Байканов, или с двойным «н» — Байкеннов, но современная орфография устоялась как Байкенов. Носительницы фамилии Байкенова могут быть уверены: их предок носил имя, которое в степи звучало как комплимент — «богатый и щедрый».