Фамилия Байкиев, судя по всему, образована от тюркского имени или прозвища. Основа «Байкы» (варианты — Байку, Байко) в тюркских языках составная: «бай» означает «богатый», «господин», «хозяин», вторая часть может восходить к слову «ку» (счастье, удача) или к глаголу со значением «защищать», «оберегать». Получается смысл вроде «богатый защитник» или «счастливый господин». Встречается и более прозаичная версия: в некоторых тюркских диалектах «байкы» — это «крикливый», «шумный», и прозвище могли дать человеку с громким голосом или бойким нравом.

Русский суффикс -ев (а не -ов) указывает на то, что исходная основа оканчивалась на мягкий согласный или гласный. В данном случае «Байки» — скорее всего, адаптированная форма, которая в русском языке получила типичное патронимическое окончание. Такая модель характерна для фамилий, которые фиксировались у татар, башкир, казахов и других народов, входивших в состав Российской империи, когда их имена русифицировали при переписях и в документах.

Географически фамилия Байкиев чаще всего встречается среди татар и башкир, особенно в Оренбургской, Челябинской областях и в Башкортостане. Встречается она и у северокавказских народов, например у чеченцев и ингушей, но там она, скорее всего, имеет другую этимологию — от вайнахского «байк» (ястреб) или от имени Байки, которое не связано с тюркским «бай». Установить точное происхождение в конкретном случае можно только по семейному преданию или по данным о регионе, откуда родом предки.

Социальный состав носителей фамилии был разнородным. В дореволюционных записях Байкиевы встречаются и среди крестьян, и среди служилых татар, и среди башкирских вотчинников. Никакого единого сословного «потолка» у фамилии нет — это обычная патронимическая фамилия, которая закрепилась в разных слоях общества.