Фамилия Баймеев — типичный пример русской фамилии, образованной от тюркского имени. Её основа — мужское имя Баймей, которое переводят как «вот господин» или «вот богач». Первая часть, «бай», в тюркских языках означает «хозяин», «богатый человек» или «могущественный». Вторая часть «ме» — указательная частица со значением «вот», «именно». Имя в целом звучало как пожелание: родители, называя так сына, словно говорили «вот наш господин», желая ему высокого статуса и достатка.

Сама фамилия строится по классической русской модели: к основе Баймей добавили патронимический суффикс -ев, который указывает на принадлежность («чей?» — Баймеев). Так на Руси оформляли инородные имена в фамилии, особенно в среде крещёных татар, башкир и других тюркских народов. В отличие от более частых фамилий на -ов, вариант с -ев здесь возник из-за мягкого звука на конце основы (Баймей).

Интересно, что имя Баймей — не самое распространённое даже в тюркской среде. Встречаются однокоренные фамилии Баймеев, Баймиев, а также более известная Баймаков (от Баймак — «богатырь»). Географически фамилия Баймеев чаще всего фиксируется в Башкортостане, Татарстане и Оренбургской области — в регионах, где веками жили тюркские народы в тесном контакте с русскими. Сословного барьера у фамилии не было: Баймеевы могли быть и крестьянами, и купцами, и служилыми людьми, поскольку имя не указывало на реальное богатство, а лишь на родительские амбиции.