Фамилия Байшкалн — редкий случай в русском ономастиконе. Она не вписывается в привычные модели на -ов, -ин или -ский, и её происхождение почти наверняка не славянское, а балтийское. Скорее всего, перед нами латышская или литовская фамилия, адаптированная на русской почве.

Разложим её на составляющие. Корень «Байш-» может восходить к латышскому слову «baiss» или «baisīgs» — страшный, ужасный. Вторая часть, «-калн», почти прозрачна: по-латышски «kalns» означает гора. Таким образом, Байшкалн — это прозвище, которое можно перевести как «Страшная гора» или «Гора ужаса». Вряд ли речь идёт о буквальной горе, вызывающей страх. Скорее, так могли назвать человека, жившего у крутого, обрывистого холма, который казался опасным, или же дать прозвище суровому, неприступному человеку.

Модель образования проста: сложение двух основ (baiss + kalns) без дополнительных суффиксов. Это характерно для многих балтийских фамилий, где прозвище прямо переходило в фамилию. У латышей фамилии стали массово закрепляться в XIX веке, и часто они брались от названий местности, свойств характера или внешности. В русском языке такая фамилия осталась без изменений, потому что суффиксы -ов или -ин просто не требовались для её «обрусения» — она и так звучала как цельное слово.

Географически фамилия Байшкалн должна быть привязана к регионам, где исторически жили латыши или литовцы: Латгалия, Курземе, а также приграничные территории Псковской и Смоленской губерний, где были латышские поселения. Встречается она и в современной Латвии, но крайне редко. В России носители этой фамилии — почти наверняка потомки латышских крестьян, переселившихся в центральные губернии в конце XIX — начале XX века, или же люди, чьи предки были онемечены и затем русифицированы.

Спорных версий здесь немного. Можно было бы предположить немецкое влияние, разбив фамилию на «Baish» и «kahn» (нем. Kahn — лодка), но это натяжка: сочетание «-калн» слишком характерно именно для балтийских языков. Вариант с финно-угорским корнем тоже маловероятен, так как в прибалтийско-финских языках слово «гора» звучит иначе. Поэтому основная и самая правдоподобная версия — латышская основа с прозрачной географической или прозвищной мотивацией.