Фамилия Бегларя ведет начало не от славянского, а от тюркского имени Беглар. В переводе на русский язык оно означает «князь» или «бек» — титул знатного человека, военачальника. Родители, давая ребенку такое имя, желали ему высокого положения и власти.

По своей модели фамилия Бегларя — нестандартная для русского быта. Она не содержит привычных суффиксов -ов, -ин или -ский, которые обычно показывали принадлежность к роду («чей сын?»). Окончание -я характерно для фамилий армянского происхождения, где оно указывает на принадлежность или происхождение. В армянском языке суффикс -ян (или -яц) означает «из рода такого-то». Форма Бегларя — это русифицированный или сокращенный вариант от Бегларян, где конечное -н могло отпасть при адаптации в русской среде. Таким образом, фамилия Бегларя означает «из рода Бегларов», то есть потомок человека по имени Беглар.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где исторически пересекались армянские и тюркские народы: Закавказье, Кубань, Ставрополье. Встречается она и у армян, и у народов, испытавших тюркское влияние. Имя Беглар в основе — не личное прозвище, а титул, что делает фамилию не просто родовой, но и указывающей на социальные ожидания предков. Сравните с фамилиями Беков, Бекмурзаев — они построены по схожему принципу, но с разными суффиксами. Бегларя выделяется именно своим армянским окончанием, которое сразу выдает неславянский корень рода.