Фамилия Бекбауова — яркий пример казахской (и шире — тюркской) модели образования фамилий, которая отличается от привычной русской системы на -ов/-ев. В этой фамилии легко читается составная основа, и её разбор сразу даёт ответ на вопрос о происхождении.

В центре фамилии лежит имя Бекбау (или Бекбауы). Оно, в свою очередь, сложено из двух тюркских корней: «бек» (вождь, господин, князь) и «бау» (связь, узы, верёвка, а также — в переносном смысле — завет, обещание, союз). Таким образом, имя Бекбау можно истолковать как «союз с беком», «узы господина» или «верный господину». Это типичное для тюркской ономастики имя-пожелание, которое должно было обеспечить мальчику покровительство сильного человека или верность данному слову.

Фамильный суффикс — -ова указывает на женскую форму. Мужской вариант — Бекбауов. Окончание -ов здесь не русское по происхождению, а является результатом русификации казахских фамилий в советский период. Изначально, в казахской среде, родовое имя звучало бы как Бекбау-улы (сын Бекбау) для мужчины и Бекбау-кызы (дочь Бекбау) для женщины. В 1930–1940-е годы, при массовой паспортизации, такие патронимы были переделаны по русскому образцу: к основе добавили -ов/-ев, а для женщин — -ова/-ева. Так Бекбау стал Бекбауовым.

Географически фамилия Бекбауова распространена прежде всего в Казахстане, особенно в южных и западных регионах, где сильны родоплеменные связи. В России она встречается редко, преимущественно среди казахов, переехавших в приграничные области (Астраханская, Оренбургская) или в крупные города. Носители фамилии, скорее всего, происходят из рода, где имя Бекбау было личным именем основателя.

От других фамилий на -бау (например, Сарыбауов, Карабауов) Бекбауова отличается именно первым компонентом «бек», который указывает на более высокий социальный статус предка. Если «Сарыбау» — это «жёлтая (рыжая) связь», то есть прозвище по внешности, то «Бекбау» — это имя, данное с надеждой на власть и верность. Это редкий случай, когда в фамилии сохранилась не просто примета, а социальное пожелание.