Фамилия Белогубкина — женская форма от Белогубкин, и её разумнее начинать с мужского варианта. При поверхностном взгляде кажется, что перед нами типичная фамилия-прилагательное с суффиксом -ин, образованная от прозвища Белая Губка или Белогубка. Но в русской ономастике не всё так прямолинейно.

Слово «губка» в старину имело два основных значения. Первое — уменьшительное от «губа» (часть лица). Прозвище Белогубый давали человеку с бледными или светлыми губами, а Белогубка — его производное. Но есть и второй, менее очевидный смысл: «губка» — это гриб (например, берёзовая губка-трутовик) или пористый материал. Белогубкой могли назвать сборщика грибов, торговца трутовиком (использовался как трут для огня) или человека, занимавшегося выделкой губок для мытья. Вторая версия правдоподобнее, если учесть, что фамилии на -ин чаще образовывались от названий профессий и предметов, чем от внешних черт. В словаре Б. Унбегауна указано, что суффикс -ин в русских фамилиях указывает на принадлежность к лицу или предмету: «чей?» — Белогубкин, то есть сын Белогубки.

Географически фамилия редкая и, судя по архивным записям, тяготеет к северным и центральным губерниям России — Вологодской, Костромской, Нижегородской. В этих краях было развито бортничество и сбор лесных даров, так что связь с «губкой»-грибом выглядит естественной. Встречается и вариант Белогубов, но он образован от полной формы Белогуб, что ещё раз подтверждает: основа не обязательно женского рода.

Сословно Белогубкины, скорее всего, относились к крестьянам или мещанам. Дворянских родов с такой фамилией в родословных книгах не зафиксировано, что типично для прозвищных фамилий, возникших в среде простого люда. Ударение в фамилии, судя по произносительной норме, падает на второй слог: Белогу́бкина.