Фамилия Бердакин образована от прозвища Берда, и ее разбор — хороший пример того, как одно слово может вести к совершенно разным историям предков. Словообразовательная модель здесь двойная: сначала прозвище получило украинский или белорусский суффикс -ак (Бердак), а затем, при переходе семьи в Россию, произошла русификация — добавился типичный русский суффикс принадлежности -ин. Так Бердак стал Бердакиным, то есть «сыном Бердака».

Сам корень — «берда» — многозначен. Самая прямая версия отсылает к ремеслу: берда — это гребень ткацкого станка, основная деталь, через которую пропускают нити основы. Прозвище Берда мог получить ткач или мастер по изготовлению таких станков. Вторая версия, опирающаяся на украинское «берда» в значении «сторож», рисует образ предка-охранника. Третья, самая психологичная, связывает прозвище с глаголом «бердить» — подавшись вперед, пятиться назад, колебаться. Тогда Бердой могли назвать человека нерешительного, осторожного, который как бы «бердит» перед каждым шагом.

Выбрать одну версию сложно, но ремесленная кажется наиболее конкретной: прозвища по профессии давали чаще, чем по малозаметной черте характера. Географически фамилия тяготеет к западнорусским землям и Украине — об этом говорит первичный суффикс -ак, который в русской ономастике встречается реже, чем на юго-западе. Со временем род перебрался в великорусские губернии, где фамилию и «обкатали» до привычного вида с окончанием -ин.