Фамилия Бердигалиев — одна из тех, что ведут на восток, в тюрко-монгольский мир и исламскую культуру. Её основа — мужское имя Бердигали (или Бердыгали), которое сложено из двух частей: «берди» (от тюркского «бер» — дал, дающий) и «гали» (от арабского «али» — высокий, великий, возвышенный). Вместе имя можно истолковать как «данный Всевышним» или «дарованный великим» — типичная для мусульманских имён формула, подчёркивающая божественный дар.

Фамилию образовали по русской модели с суффиксом -ев, который в тюркских фамилиях часто прикрепляется к именам, оканчивающимся на согласный (в данном случае на мягкий «и»). Это указывает на то, что предок носителя фамилии, скорее всего, был назван Бердигали, а его потомки стали Бердигалиевыми. Встречаются и варианты написания — через «ы» (Бердыгалиев), что отражает диалектное произношение, где гласный звук редуцируется.

Географически фамилия характерна для Казахстана, особенно западных и южных регионов, а также для тех общин, где распространены тюрко-персидские и арабские заимствования в именослове. В России она редка и встречается в основном среди выходцев из Средней Азии. Корень «берди» роднит её с фамилиями Бердиев, Бердыев, Бердимуратов — все они отсылают к идее дара или дающего, что было типично для имён-пожеланий.

Сословно Бердигалиевы могли быть как крестьянами-скотоводами, так и представителями духовенства или торговцами — имя не несёт жёсткой социальной привязки. Сложно сказать, когда именно фамилия закрепилась: в советское время, при паспортизации 1920–1930-х годов, многие тюркские родовые имена превратились в фамилии, поэтому Бердигалиев — скорее поздний, «кабинетный» вариант, чем древняя родовая метка.