Фамилия Бердиков образована от прозвища Бердик. По одной из версий, оно ведет свое начало от нарицательного «бердо» со значением «основная рабочая деталь ткацкого станка в виде гребня». Вероятно, это прозвище относится к так называемым «профессиональным» именованиям, указывающим на род деятельности основателя фамилии: он мог быть ткачом. Распространенность профессии ткача во все времена объясняет популярность фамилий, связанных с ней. Менее вероятно, что фамилия Бердиков имеет арабо-мусульманские корни. Возможно, в основу фамилии Бердиков легло тюркское имя Берди (точнее, его форма Бердик), которое означает «он (Бог) дал». Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Бердик, со временем получил фамилию Бердиков.