Фамилия Бердикеев образована от тюркского личного имени Бердикей. Разберём её по составу: основа Бердикей, где -ей — уменьшительно-ласкательный суффикс (распространён в татарской, башкирской, казахской антропонимии), а русский патронимический суффикс -ев указывает на принадлежность: «сын Бердикея». Само имя Бердикей восходит к тюркскому корню «берди» — «дал», то есть «данный (Богом)». Это типичное имя-оберег, которое давали ребёнку, чтобы подчеркнуть, что он — дар свыше, или чтобы «откупиться» от злых духов, показав, что младенец не представляет ценности.

Географически фамилия тяготеет к Волго-Уральскому региону и Западной Сибири. Наибольшая концентрация носителей — в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской и Челябинской областях. Встречается она и у сибирских татар, что указывает на общий этнический источник. В русских переписных книгах XVI–XVII веков подобные имена фиксировались у служилых татар и новокрещенов, которые могли получить фамилию по отцу при переходе на русскую службу или при крещении.

Интересная деталь: фамилия сохранила архаичную форму с суффиксом -еев, а не -ев, что встречается реже. В некоторых говорах и старых записях можно найти вариант Бердикеев, где -е- под ударением — это остаток тюркского широкого гласного, который в русской адаптации не редуцировался. Если сравнивать с однокоренными фамилиями — Бердиевы, Бердины, Бердигуловы — то Бердикеев выделяется именно уменьшительным суффиксом, который в тюркских языках мог придавать имени оттенок ласки или указывать на младшего в роду.

Сословная принадлежность предков не восстанавливается однозначно: это могли быть и рядовые общинники, и служилые люди. В документах XIX века Бердикеевы встречаются среди государственных крестьян, реже — среди мещан. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано, что говорит о её простонародном происхождении.