Фамилия Бердыбеков имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Бердыбеков уходит в XV-XVII вв. Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Бердыбеков являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Фамилия Бердыбеков образована от тюркского мужского имени Бердыбек, которое восходит к двум основам. Первая из них, ведет свое начало от имени Берди, которое означает «он (Бог) дал». Вторая часть фамилии, «бек», переводится как «князь, повелитель, начальник, руководитель, глава, хозяин, господин». Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Бердыбеков способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Тем не менее, фамилия Бердыбеков представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.